通过与政府深化合作，以“信息统一与共享、业务管理统一与共享、资源管理统一与共享”为靶向，以“管理输出+技术输出”为载体，去领办当地区域龙头医疗机构，由当地龙头医疗机构向下辐射区域内的医疗卫生机构，从而构筑起跨区域、覆盖全域的“华西医院-地市级医院-县级医院-基层医疗机构”分级协同医疗服务体系。

为充分发挥华西医院作为国家级疑难重症医疗中心、国家临床医学研究中心及医疗协同网络平台的作用，辐射和带动区域内、区域间医疗服务能力提升和医疗服务同质化，2016年起，华西医院以优质学科资源为支撑，学科协作为纽带，在已有医疗集团型医联体、领办型医联体、远程医疗协作网、城市社区联盟的基础上逐步探索学科联盟医联体模式，组建以西部地区为主、辐射全国的特色专科医联体。
截至目前，四川大学华西医院已牵头成立30个学科联盟，学科覆盖心脏内科、脑卒中、急诊、精神卫生、疼痛、耳鼻咽喉头颈外科、康复、泌尿、血液、营养、皮肤、检验、感染与肝病、消化内科、烧伤、乳腺、骨科、呼吸与危重症、视光、重症医学、肾科、消化外科、神经精神影像、神经外科、创伤、胸外、肝胆外科、肿瘤、小儿外科、包虫病。来自全国30个省、直辖市、自治区共计730余家兄弟医院2000余个兄弟科室加入其中。华西学科联盟旨在进一步加强联盟单位学科内涵建设，在联盟内推广专科诊疗规范，推进疾病分级诊疗，建立专科医疗团队同质化培养体系，加强科研合作，促进西部地区学科整体能力提升。